Estará integrado por el Rector y el Secretario General (presidente y secretario, respectivamente); los Coordinadores Generales, Coordinadores Generales de Unidad, representantes propietarios y suplentes de Académicos de los Programas Educativos de Licenciatura y Postgrado; y un Estudiante propietario y suplente por cada Coordinación General de Unidad de la Universidad.

Este órgano, que es presidido por el Rector  y en el que el Secretario General funge como el Secretario del Consejo, posee una estructura que garantiza la efectiva toma de decisiones y una dinámica de trabajo en que los consejeros y las comisiones se reúnen periódicamente para realizar actividades de análisis de asuntos internos, revisión de la reglamentación universitaria aplicada a la UAIS y de poner a disposición de la comunidad los documentos relacionados con los diversos programas específicos de estudios, de estímulos, de actualización y superación académicas, de trabajo del personal académico, de difusión, de evaluación, entre otros.